Protein–RNA interactions for Protein: G3UYA8

Vmn2r38, Vomeronasal 2, receptor 38, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r38G3UYA8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r38G3UYA8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r38G3UYA8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r38G3UYA8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn2r38G3UYA8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r38G3UYA8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn2r38G3UYA8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn2r38G3UYA8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn2r38G3UYA8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn2r38G3UYA8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn2r38G3UYA8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn2r38G3UYA8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn2r38G3UYA8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vmn2r38G3UYA8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vmn2r38G3UYA8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vmn2r38G3UYA8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn2r38G3UYA8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn2r38G3UYA8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r38G3UYA8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r38G3UYA8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r38G3UYA8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r38G3UYA8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r38G3UYA8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r38G3UYA8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r38G3UYA8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r38G3UYA8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms