Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm340F6RGI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm340F6RGI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm340F6RGI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm340F6RGI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm340F6RGI3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm340F6RGI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm340F6RGI3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm340F6RGI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm340F6RGI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm340F6RGI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm340F6RGI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm340F6RGI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm340F6RGI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm340F6RGI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm340F6RGI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm340F6RGI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm340F6RGI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm340F6RGI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm340F6RGI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm340F6RGI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm340F6RGI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm340F6RGI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm340F6RGI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm340F6RGI3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm340F6RGI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm340F6RGI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm340F6RGI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm340F6RGI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm340F6RGI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm340F6RGI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm340F6RGI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms