Protein–RNA interactions for Protein: E9Q349

Wdr25, WD repeat-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr25E9Q349 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr25E9Q349 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr25E9Q349 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr25E9Q349 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr25E9Q349 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr25E9Q349 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr25E9Q349 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr25E9Q349 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr25E9Q349 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr25E9Q349 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr25E9Q349 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wdr25E9Q349 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr25E9Q349 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr25E9Q349 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr25E9Q349 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr25E9Q349 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr25E9Q349 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr25E9Q349 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr25E9Q349 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr25E9Q349 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr25E9Q349 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Wdr25E9Q349 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr25E9Q349 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr25E9Q349 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr25E9Q349 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr25E9Q349 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr25E9Q349 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Wdr25E9Q349 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wdr25E9Q349 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Wdr25E9Q349 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr25E9Q349 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr25E9Q349 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr25E9Q349 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr25E9Q349 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms