Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp558E9Q1J0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp558E9Q1J0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp558E9Q1J0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp558E9Q1J0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp558E9Q1J0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp558E9Q1J0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp558E9Q1J0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp558E9Q1J0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp558E9Q1J0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp558E9Q1J0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp558E9Q1J0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp558E9Q1J0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp558E9Q1J0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp558E9Q1J0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp558E9Q1J0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp558E9Q1J0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp558E9Q1J0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp558E9Q1J0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp558E9Q1J0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp558E9Q1J0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
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