Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ErmardE9Q048 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ErmardE9Q048 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ErmardE9Q048 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ErmardE9Q048 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ErmardE9Q048 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ErmardE9Q048 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ErmardE9Q048 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ErmardE9Q048 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ErmardE9Q048 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ErmardE9Q048 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ErmardE9Q048 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ErmardE9Q048 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ErmardE9Q048 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ErmardE9Q048 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ErmardE9Q048 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ErmardE9Q048 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ErmardE9Q048 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ErmardE9Q048 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ErmardE9Q048 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ErmardE9Q048 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ErmardE9Q048 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ErmardE9Q048 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ErmardE9Q048 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ErmardE9Q048 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ErmardE9Q048 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ErmardE9Q048 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ErmardE9Q048 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ErmardE9Q048 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ErmardE9Q048 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ErmardE9Q048 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ErmardE9Q048 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ErmardE9Q048 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ErmardE9Q048 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ErmardE9Q048 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ErmardE9Q048 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ErmardE9Q048 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ErmardE9Q048 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ErmardE9Q048 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ErmardE9Q048 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ErmardE9Q048 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ErmardE9Q048 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ErmardE9Q048 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms