Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gm20425E9Q035 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gm20425E9Q035 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gm20425E9Q035 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Gm20425E9Q035 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gm20425E9Q035 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Gm20425E9Q035 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm20425E9Q035 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm20425E9Q035 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gm20425E9Q035 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gm20425E9Q035 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gm20425E9Q035 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Gm20425E9Q035 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20425E9Q035 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm20425E9Q035 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gm20425E9Q035 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gm20425E9Q035 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm20425E9Q035 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm20425E9Q035 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20425E9Q035 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gm20425E9Q035 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm20425E9Q035 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm20425E9Q035 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm20425E9Q035 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gm20425E9Q035 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gm20425E9Q035 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20425E9Q035 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20425E9Q035 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20425E9Q035 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20425E9Q035 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm20425E9Q035 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gm20425E9Q035 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gm20425E9Q035 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gm20425E9Q035 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gm20425E9Q035 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm20425E9Q035 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm20425E9Q035 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gm20425E9Q035 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gm20425E9Q035 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gm20425E9Q035 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gm20425E9Q035 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gm20425E9Q035 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 728.6 ms