Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp944E9PUS4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp944E9PUS4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp944E9PUS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp944E9PUS4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp944E9PUS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp944E9PUS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp944E9PUS4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp944E9PUS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp944E9PUS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp944E9PUS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp944E9PUS4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp944E9PUS4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp944E9PUS4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp944E9PUS4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp944E9PUS4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp944E9PUS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp944E9PUS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp944E9PUS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp944E9PUS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp944E9PUS4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp944E9PUS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp944E9PUS4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp944E9PUS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms