Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc170D3YXL0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc170D3YXL0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc170D3YXL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc170D3YXL0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc170D3YXL0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc170D3YXL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc170D3YXL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc170D3YXL0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc170D3YXL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc170D3YXL0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc170D3YXL0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc170D3YXL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc170D3YXL0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc170D3YXL0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc170D3YXL0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc170D3YXL0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc170D3YXL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc170D3YXL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc170D3YXL0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc170D3YXL0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc170D3YXL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc170D3YXL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc170D3YXL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc170D3YXL0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc170D3YXL0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc170D3YXL0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc170D3YXL0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc170D3YXL0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc170D3YXL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc170D3YXL0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc170D3YXL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms