Protein–RNA interactions for Protein: D3YVJ1

Gm5901, Predicted gene 5901, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5901D3YVJ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5901D3YVJ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5901D3YVJ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5901D3YVJ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5901D3YVJ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5901D3YVJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5901D3YVJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5901D3YVJ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5901D3YVJ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5901D3YVJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5901D3YVJ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5901D3YVJ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5901D3YVJ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5901D3YVJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5901D3YVJ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5901D3YVJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5901D3YVJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5901D3YVJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5901D3YVJ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5901D3YVJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5901D3YVJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5901D3YVJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5901D3YVJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5901D3YVJ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5901D3YVJ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5901D3YVJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5901D3YVJ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5901D3YVJ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5901D3YVJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5901D3YVJ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5901D3YVJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5901D3YVJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5901D3YVJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5901D3YVJ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5901D3YVJ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5901D3YVJ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5901D3YVJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5901D3YVJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5901D3YVJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5901D3YVJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5901D3YVJ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5901D3YVJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms