Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim30cD3YVI9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim30cD3YVI9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30cD3YVI9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30cD3YVI9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim30cD3YVI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim30cD3YVI9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim30cD3YVI9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim30cD3YVI9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim30cD3YVI9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim30cD3YVI9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30cD3YVI9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim30cD3YVI9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim30cD3YVI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim30cD3YVI9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim30cD3YVI9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim30cD3YVI9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Trim30cD3YVI9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim30cD3YVI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim30cD3YVI9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30cD3YVI9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30cD3YVI9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim30cD3YVI9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim30cD3YVI9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30cD3YVI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30cD3YVI9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim30cD3YVI9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30cD3YVI9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30cD3YVI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms