Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Itga9B8JK39 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itga9B8JK39 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Itga9B8JK39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Itga9B8JK39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Itga9B8JK39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Itga9B8JK39 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Itga9B8JK39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Itga9B8JK39 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Itga9B8JK39 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Itga9B8JK39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Itga9B8JK39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Itga9B8JK39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Itga9B8JK39 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Itga9B8JK39 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Itga9B8JK39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Itga9B8JK39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Itga9B8JK39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Itga9B8JK39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Itga9B8JK39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Itga9B8JK39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Itga9B8JK39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Itga9B8JK39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Itga9B8JK39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Itga9B8JK39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Itga9B8JK39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Itga9B8JK39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Itga9B8JK39 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,95■■□□□ 1,75
Itga9B8JK39 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Itga9B8JK39 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Itga9B8JK39 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Itga9B8JK39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Itga9B8JK39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Itga9B8JK39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Itga9B8JK39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,8 ms