Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnldc1B2RXZ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pnldc1B2RXZ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pnldc1B2RXZ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pnldc1B2RXZ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pnldc1B2RXZ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pnldc1B2RXZ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pnldc1B2RXZ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pnldc1B2RXZ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnldc1B2RXZ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pnldc1B2RXZ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnldc1B2RXZ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pnldc1B2RXZ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnldc1B2RXZ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnldc1B2RXZ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnldc1B2RXZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnldc1B2RXZ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pnldc1B2RXZ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnldc1B2RXZ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pnldc1B2RXZ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pnldc1B2RXZ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnldc1B2RXZ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnldc1B2RXZ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnldc1B2RXZ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnldc1B2RXZ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnldc1B2RXZ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pnldc1B2RXZ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnldc1B2RXZ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms