Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rd3lB2RV38 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3lB2RV38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3lB2RV38 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3lB2RV38 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3lB2RV38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3lB2RV38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3lB2RV38 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rd3lB2RV38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rd3lB2RV38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3lB2RV38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rd3lB2RV38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rd3lB2RV38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.9 ms