Protein–RNA interactions for Protein: B1AX39

Zcchc7, Zinc finger CCHC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc7B1AX39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc7B1AX39 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc7B1AX39 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc7B1AX39 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc7B1AX39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc7B1AX39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc7B1AX39 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc7B1AX39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Zcchc7B1AX39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zcchc7B1AX39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc7B1AX39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc7B1AX39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc7B1AX39 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc7B1AX39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc7B1AX39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc7B1AX39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc7B1AX39 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc7B1AX39 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc7B1AX39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc7B1AX39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc7B1AX39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc7B1AX39 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc7B1AX39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc7B1AX39 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc7B1AX39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc7B1AX39 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc7B1AX39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc7B1AX39 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc7B1AX39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zcchc7B1AX39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zcchc7B1AX39 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc7B1AX39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc7B1AX39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc7B1AX39 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc7B1AX39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms