Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
A630010A05RikA9C473 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A630010A05RikA9C473 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A630010A05RikA9C473 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A630010A05RikA9C473 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A630010A05RikA9C473 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A630010A05RikA9C473 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A630010A05RikA9C473 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A630010A05RikA9C473 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A630010A05RikA9C473 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A630010A05RikA9C473 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A630010A05RikA9C473 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A630010A05RikA9C473 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A630010A05RikA9C473 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
A630010A05RikA9C473 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A630010A05RikA9C473 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A630010A05RikA9C473 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A630010A05RikA9C473 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A630010A05RikA9C473 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A630010A05RikA9C473 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A630010A05RikA9C473 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A630010A05RikA9C473 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A630010A05RikA9C473 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A630010A05RikA9C473 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A630010A05RikA9C473 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A630010A05RikA9C473 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A630010A05RikA9C473 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A630010A05RikA9C473 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A630010A05RikA9C473 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A630010A05RikA9C473 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A630010A05RikA9C473 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A630010A05RikA9C473 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A630010A05RikA9C473 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A630010A05RikA9C473 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A630010A05RikA9C473 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms