Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint4A7TZF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint4A7TZF3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint4A7TZF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint4A7TZF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint4A7TZF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint4A7TZF3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint4A7TZF3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint4A7TZF3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint4A7TZF3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint4A7TZF3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint4A7TZF3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint4A7TZF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint4A7TZF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint4A7TZF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint4A7TZF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint4A7TZF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint4A7TZF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint4A7TZF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint4A7TZF3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint4A7TZF3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint4A7TZF3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint4A7TZF3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint4A7TZF3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint4A7TZF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint4A7TZF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint4A7TZF3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint4A7TZF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint4A7TZF3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint4A7TZF3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms