Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll3A4Q9E5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll3A4Q9E5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll3A4Q9E5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll3A4Q9E5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll3A4Q9E5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll3A4Q9E5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll3A4Q9E5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll3A4Q9E5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll3A4Q9E5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll3A4Q9E5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll3A4Q9E5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll3A4Q9E5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll3A4Q9E5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll3A4Q9E5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll3A4Q9E5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll3A4Q9E5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll3A4Q9E5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll3A4Q9E5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll3A4Q9E5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll3A4Q9E5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll3A4Q9E5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttll3A4Q9E5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll3A4Q9E5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll3A4Q9E5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll3A4Q9E5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll3A4Q9E5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll3A4Q9E5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll3A4Q9E5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttll3A4Q9E5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll3A4Q9E5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms