Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xlr4aA2BI40 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xlr4aA2BI40 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xlr4aA2BI40 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xlr4aA2BI40 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xlr4aA2BI40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xlr4aA2BI40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xlr4aA2BI40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xlr4aA2BI40 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xlr4aA2BI40 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr4aA2BI40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr4aA2BI40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr4aA2BI40 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr4aA2BI40 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr4aA2BI40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr4aA2BI40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.7 ms