Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc43a3A2AVZ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc43a3A2AVZ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc43a3A2AVZ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc43a3A2AVZ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc43a3A2AVZ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc43a3A2AVZ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc43a3A2AVZ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc43a3A2AVZ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc43a3A2AVZ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc43a3A2AVZ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc43a3A2AVZ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc43a3A2AVZ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc43a3A2AVZ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc43a3A2AVZ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc43a3A2AVZ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc43a3A2AVZ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc43a3A2AVZ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc43a3A2AVZ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc43a3A2AVZ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc43a3A2AVZ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc43a3A2AVZ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc43a3A2AVZ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc43a3A2AVZ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc43a3A2AVZ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc43a3A2AVZ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc43a3A2AVZ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc43a3A2AVZ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc43a3A2AVZ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc43a3A2AVZ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc43a3A2AVZ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc43a3A2AVZ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc43a3A2AVZ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc43a3A2AVZ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc43a3A2AVZ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc43a3A2AVZ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc43a3A2AVZ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc43a3A2AVZ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms