Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
CerklA2AQH1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
CerklA2AQH1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CerklA2AQH1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CerklA2AQH1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
CerklA2AQH1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CerklA2AQH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
CerklA2AQH1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
CerklA2AQH1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
CerklA2AQH1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
CerklA2AQH1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
CerklA2AQH1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
CerklA2AQH1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
CerklA2AQH1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
CerklA2AQH1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
CerklA2AQH1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
CerklA2AQH1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
CerklA2AQH1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
CerklA2AQH1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
CerklA2AQH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
CerklA2AQH1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
CerklA2AQH1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
CerklA2AQH1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
CerklA2AQH1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
CerklA2AQH1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
CerklA2AQH1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
CerklA2AQH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
CerklA2AQH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
CerklA2AQH1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
CerklA2AQH1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
CerklA2AQH1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
CerklA2AQH1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,22■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
CerklA2AQH1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
CerklA2AQH1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
CerklA2AQH1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
CerklA2AQH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,5 ms