Protein–RNA interactions for Protein: A2AFI6

Gm364, Transmembrane 9 superfamily member, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm364A2AFI6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm364A2AFI6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm364A2AFI6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm364A2AFI6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm364A2AFI6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm364A2AFI6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm364A2AFI6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm364A2AFI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm364A2AFI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm364A2AFI6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm364A2AFI6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm364A2AFI6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm364A2AFI6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm364A2AFI6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm364A2AFI6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm364A2AFI6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm364A2AFI6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm364A2AFI6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm364A2AFI6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms