Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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