Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUM1

Gm7682, Predicted gene 7682, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7682A0A0J9YUM1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm7682A0A0J9YUM1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm7682A0A0J9YUM1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm7682A0A0J9YUM1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm7682A0A0J9YUM1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm7682A0A0J9YUM1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm7682A0A0J9YUM1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm7682A0A0J9YUM1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm7682A0A0J9YUM1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm7682A0A0J9YUM1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm7682A0A0J9YUM1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm7682A0A0J9YUM1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm7682A0A0J9YUM1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm7682A0A0J9YUM1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7682A0A0J9YUM1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7682A0A0J9YUM1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7682A0A0J9YUM1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7682A0A0J9YUM1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7682A0A0J9YUM1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7682A0A0J9YUM1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7682A0A0J9YUM1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7682A0A0J9YUM1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7682A0A0J9YUM1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm7682A0A0J9YUM1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7682A0A0J9YUM1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7682A0A0J9YUM1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7682A0A0J9YUM1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms