Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM3Q9BZL3 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms