Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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