Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms