Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP46P62068 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP46P62068 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP46P62068 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP46P62068 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP46P62068 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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