Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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