Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms