Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms