Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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