Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms