Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOL6Q9BWW8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms