Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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