Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms