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| PTPRJ | Q12913 | FCRL1-207 | ENST00000491942 | 1554 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.96 | □□□□□ -0.01 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AF013593.1-201 | ENST00000458074 | 1487 nt | BASIC | 14.96 | □□□□□ -0.01 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RGS8-204 | ENST00000483095 | 1432 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.96 | □□□□□ -0.01 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNAPC2-206 | ENST00000597584 | 1413 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.96 | □□□□□ -0.01 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | NFATC4-221 | ENST00000555453 | 3169 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL445250.1-201 | ENST00000641671 | 2259 nt | BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LDB3-204 | ENST00000372066 | 1598 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEZ6L-209 | ENST00000529632 | 6534 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | B4GALT6-201 | ENST00000237019 | 2128 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPH1-201 | ENST00000329433 | 2114 nt | TSL 2 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | MRVI1-204 | ENST00000527509 | 2686 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM156A-208 | ENST00000615092 | 2098 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AGO3-201 | ENST00000246314 | 3211 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRMT10B-202 | ENST00000377753 | 2027 nt | TSL 2 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PPFIA3-203 | ENST00000602351 | 4341 nt | TSL 5 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PLAT-203 | ENST00000429089 | 2599 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CPA5-201 | ENST00000393213 | 1444 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CCNG2-202 | ENST00000395640 | 1410 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL139193.2-201 | ENST00000553712 | 1954 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MGC16275-201 | ENST00000499670 | 2501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |