Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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