Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP4P49662 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms