Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms