Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRHRP34981 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms