Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms