Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 MYEF2-217ENST00000620867 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 NMRAL2P-201ENST00000306399 891 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 NAALAD2-202ENST00000375944 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AL592049.1-201ENST00000422490 1188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC012506.2-201ENST00000426527 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AL035425.1-202ENST00000436013 1142 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 NIFKP2-201ENST00000513462 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 LEPROTL1-208ENST00000523116 1389 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 UBTFL11-201ENST00000428234 2252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms