Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DENRO43583 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DENRO43583 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DENRO43583 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
DENRO43583 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
DENRO43583 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DENRO43583 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DENRO43583 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms