Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms