Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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