Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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PCDH10Q9P2E7 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PCDH10Q9P2E7 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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