Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MCMBPQ9BTE3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms