Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms