Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms