Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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