Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GK3PQ14409 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms